Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXNA3P51805 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA3P51805 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms