Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAPOLAP51003 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms