Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX5P50542 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX5P50542 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX5P50542 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX5P50542 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX5P50542 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX5P50542 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX5P50542 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX5P50542 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX5P50542 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX5P50542 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX5P50542 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX5P50542 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX5P50542 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX5P50542 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX5P50542 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX5P50542 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX5P50542 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX5P50542 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX5P50542 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX5P50542 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX5P50542 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX5P50542 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX5P50542 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX5P50542 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX5P50542 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX5P50542 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX5P50542 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX5P50542 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX5P50542 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX5P50542 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX5P50542 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX5P50542 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX5P50542 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX5P50542 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX5P50542 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX5P50542 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX5P50542 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PEX5P50542 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PEX5P50542 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PEX5P50542 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PEX5P50542 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PEX5P50542 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX5P50542 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX5P50542 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX5P50542 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX5P50542 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX5P50542 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX5P50542 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX5P50542 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX5P50542 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX5P50542 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX5P50542 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX5P50542 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX5P50542 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX5P50542 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX5P50542 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX5P50542 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX5P50542 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX5P50542 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX5P50542 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX5P50542 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX5P50542 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX5P50542 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX5P50542 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX5P50542 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX5P50542 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX5P50542 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX5P50542 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX5P50542 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX5P50542 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX5P50542 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX5P50542 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX5P50542 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX5P50542 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX5P50542 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX5P50542 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX5P50542 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX5P50542 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX5P50542 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX5P50542 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX5P50542 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX5P50542 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX5P50542 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX5P50542 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX5P50542 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX5P50542 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX5P50542 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX5P50542 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX5P50542 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX5P50542 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX5P50542 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX5P50542 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX5P50542 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX5P50542 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX5P50542 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX5P50542 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX5P50542 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX5P50542 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX5P50542 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms