Protein–RNA interactions for Protein: P49589

CARS, Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARSP49589 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CARSP49589 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARSP49589 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARSP49589 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARSP49589 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARSP49589 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARSP49589 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARSP49589 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARSP49589 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARSP49589 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARSP49589 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARSP49589 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARSP49589 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARSP49589 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARSP49589 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARSP49589 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARSP49589 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARSP49589 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CARSP49589 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARSP49589 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARSP49589 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARSP49589 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CARSP49589 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARSP49589 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARSP49589 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARSP49589 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARSP49589 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARSP49589 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARSP49589 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARSP49589 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARSP49589 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARSP49589 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARSP49589 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARSP49589 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARSP49589 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARSP49589 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARSP49589 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARSP49589 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARSP49589 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARSP49589 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARSP49589 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARSP49589 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARSP49589 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARSP49589 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARSP49589 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARSP49589 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARSP49589 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CARSP49589 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARSP49589 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARSP49589 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARSP49589 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARSP49589 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARSP49589 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARSP49589 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARSP49589 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARSP49589 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARSP49589 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARSP49589 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARSP49589 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARSP49589 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARSP49589 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARSP49589 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARSP49589 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CARSP49589 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARSP49589 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARSP49589 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARSP49589 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARSP49589 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARSP49589 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARSP49589 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARSP49589 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARSP49589 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARSP49589 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARSP49589 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARSP49589 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARSP49589 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARSP49589 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARSP49589 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARSP49589 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARSP49589 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARSP49589 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARSP49589 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARSP49589 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARSP49589 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARSP49589 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARSP49589 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARSP49589 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARSP49589 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARSP49589 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARSP49589 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CARSP49589 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARSP49589 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARSP49589 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARSP49589 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARSP49589 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARSP49589 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CARSP49589 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CARSP49589 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARSP49589 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARSP49589 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms