Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC11A1P49279 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC11A1P49279 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms