Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT5P48643 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT5P48643 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT5P48643 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT5P48643 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT5P48643 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT5P48643 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT5P48643 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT5P48643 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT5P48643 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT5P48643 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT5P48643 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT5P48643 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT5P48643 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT5P48643 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT5P48643 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT5P48643 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT5P48643 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT5P48643 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT5P48643 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT5P48643 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT5P48643 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT5P48643 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT5P48643 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT5P48643 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCT5P48643 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT5P48643 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT5P48643 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT5P48643 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT5P48643 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT5P48643 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT5P48643 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT5P48643 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT5P48643 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT5P48643 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT5P48643 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT5P48643 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT5P48643 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT5P48643 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT5P48643 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT5P48643 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT5P48643 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT5P48643 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT5P48643 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT5P48643 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT5P48643 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT5P48643 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT5P48643 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT5P48643 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT5P48643 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT5P48643 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT5P48643 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT5P48643 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT5P48643 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT5P48643 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT5P48643 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT5P48643 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT5P48643 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT5P48643 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT5P48643 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT5P48643 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT5P48643 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT5P48643 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT5P48643 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT5P48643 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT5P48643 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT5P48643 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT5P48643 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT5P48643 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT5P48643 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT5P48643 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT5P48643 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT5P48643 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT5P48643 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT5P48643 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT5P48643 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT5P48643 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT5P48643 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT5P48643 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT5P48643 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT5P48643 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT5P48643 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT5P48643 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT5P48643 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT5P48643 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT5P48643 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT5P48643 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT5P48643 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT5P48643 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT5P48643 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT5P48643 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCT5P48643 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCT5P48643 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT5P48643 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT5P48643 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT5P48643 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT5P48643 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT5P48643 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT5P48643 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT5P48643 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms