Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNC1P48547 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNC1P48547 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KCNC1P48547 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNC1P48547 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC1P48547 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC1P48547 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC1P48547 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC1P48547 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC1P48547 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC1P48547 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC1P48547 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC1P48547 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KCNC1P48547 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC1P48547 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC1P48547 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC1P48547 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC1P48547 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC1P48547 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KCNC1P48547 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNC1P48547 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC1P48547 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC1P48547 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC1P48547 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC1P48547 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC1P48547 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC1P48547 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC1P48547 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC1P48547 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC1P48547 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC1P48547 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC1P48547 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC1P48547 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC1P48547 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC1P48547 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNC1P48547 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC1P48547 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC1P48547 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC1P48547 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC1P48547 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC1P48547 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC1P48547 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC1P48547 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC1P48547 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNC1P48547 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms