Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD4P46934 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms