Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
RANGAP1P46060 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC35■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC35■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RANGAP1P46060 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms