Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MKI67P46013 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKI67P46013 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKI67P46013 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKI67P46013 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKI67P46013 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MKI67P46013 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKI67P46013 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKI67P46013 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKI67P46013 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKI67P46013 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKI67P46013 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKI67P46013 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKI67P46013 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MKI67P46013 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKI67P46013 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKI67P46013 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKI67P46013 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKI67P46013 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKI67P46013 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKI67P46013 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKI67P46013 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKI67P46013 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKI67P46013 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKI67P46013 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKI67P46013 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKI67P46013 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKI67P46013 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKI67P46013 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKI67P46013 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKI67P46013 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKI67P46013 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKI67P46013 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKI67P46013 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKI67P46013 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKI67P46013 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKI67P46013 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKI67P46013 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKI67P46013 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MKI67P46013 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKI67P46013 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKI67P46013 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKI67P46013 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKI67P46013 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKI67P46013 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKI67P46013 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKI67P46013 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKI67P46013 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKI67P46013 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKI67P46013 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKI67P46013 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKI67P46013 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKI67P46013 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKI67P46013 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKI67P46013 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKI67P46013 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKI67P46013 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKI67P46013 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKI67P46013 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKI67P46013 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKI67P46013 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKI67P46013 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKI67P46013 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKI67P46013 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKI67P46013 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKI67P46013 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MKI67P46013 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKI67P46013 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKI67P46013 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKI67P46013 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKI67P46013 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKI67P46013 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKI67P46013 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKI67P46013 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MKI67P46013 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKI67P46013 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKI67P46013 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKI67P46013 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKI67P46013 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKI67P46013 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKI67P46013 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKI67P46013 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKI67P46013 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKI67P46013 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKI67P46013 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKI67P46013 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKI67P46013 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKI67P46013 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKI67P46013 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKI67P46013 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKI67P46013 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKI67P46013 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKI67P46013 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKI67P46013 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKI67P46013 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKI67P46013 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKI67P46013 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKI67P46013 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKI67P46013 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MKI67P46013 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms