Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP5P45974 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP5P45974 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP5P45974 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP5P45974 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP5P45974 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP5P45974 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP5P45974 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP5P45974 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USP5P45974 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USP5P45974 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USP5P45974 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP5P45974 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP5P45974 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP5P45974 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP5P45974 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP5P45974 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP5P45974 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP5P45974 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP5P45974 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP5P45974 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP5P45974 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP5P45974 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP5P45974 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP5P45974 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP5P45974 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP5P45974 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP5P45974 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP5P45974 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP5P45974 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP5P45974 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP5P45974 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP5P45974 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP5P45974 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP5P45974 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP5P45974 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP5P45974 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP5P45974 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP5P45974 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP5P45974 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP5P45974 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP5P45974 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP5P45974 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP5P45974 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP5P45974 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP5P45974 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP5P45974 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP5P45974 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP5P45974 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP5P45974 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP5P45974 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP5P45974 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP5P45974 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP5P45974 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP5P45974 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP5P45974 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP5P45974 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP5P45974 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP5P45974 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP5P45974 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP5P45974 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP5P45974 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP5P45974 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP5P45974 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP5P45974 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP5P45974 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP5P45974 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP5P45974 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP5P45974 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP5P45974 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP5P45974 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP5P45974 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP5P45974 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP5P45974 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP5P45974 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP5P45974 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP5P45974 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP5P45974 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP5P45974 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP5P45974 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP5P45974 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP5P45974 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP5P45974 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP5P45974 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP5P45974 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP5P45974 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP5P45974 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP5P45974 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP5P45974 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP5P45974 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP5P45974 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP5P45974 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP5P45974 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP5P45974 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP5P45974 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP5P45974 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP5P45974 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP5P45974 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP5P45974 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP5P45974 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms