Protein–RNA interactions for Protein: P43489

TNFRSF4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF4P43489 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF4P43489 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF4P43489 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms