Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCAMP43121 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCAMP43121 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCAMP43121 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCAMP43121 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCAMP43121 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCAMP43121 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCAMP43121 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCAMP43121 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCAMP43121 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCAMP43121 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCAMP43121 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MCAMP43121 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCAMP43121 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCAMP43121 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCAMP43121 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCAMP43121 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCAMP43121 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCAMP43121 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCAMP43121 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCAMP43121 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCAMP43121 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCAMP43121 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCAMP43121 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MCAMP43121 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCAMP43121 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MCAMP43121 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCAMP43121 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCAMP43121 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCAMP43121 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCAMP43121 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCAMP43121 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCAMP43121 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCAMP43121 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCAMP43121 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MCAMP43121 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCAMP43121 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCAMP43121 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCAMP43121 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCAMP43121 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCAMP43121 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCAMP43121 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCAMP43121 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCAMP43121 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCAMP43121 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCAMP43121 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCAMP43121 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCAMP43121 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCAMP43121 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCAMP43121 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MCAMP43121 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MCAMP43121 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MCAMP43121 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCAMP43121 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCAMP43121 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCAMP43121 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCAMP43121 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCAMP43121 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCAMP43121 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCAMP43121 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCAMP43121 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCAMP43121 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCAMP43121 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCAMP43121 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCAMP43121 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCAMP43121 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCAMP43121 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MCAMP43121 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCAMP43121 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCAMP43121 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCAMP43121 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MCAMP43121 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCAMP43121 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCAMP43121 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCAMP43121 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCAMP43121 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MCAMP43121 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCAMP43121 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCAMP43121 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCAMP43121 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCAMP43121 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCAMP43121 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCAMP43121 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCAMP43121 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCAMP43121 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCAMP43121 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCAMP43121 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCAMP43121 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCAMP43121 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCAMP43121 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCAMP43121 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCAMP43121 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCAMP43121 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCAMP43121 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MCAMP43121 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCAMP43121 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCAMP43121 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCAMP43121 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCAMP43121 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCAMP43121 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms