Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECI1P42126 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECI1P42126 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECI1P42126 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECI1P42126 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECI1P42126 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECI1P42126 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECI1P42126 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECI1P42126 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECI1P42126 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECI1P42126 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECI1P42126 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECI1P42126 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECI1P42126 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ECI1P42126 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECI1P42126 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECI1P42126 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECI1P42126 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECI1P42126 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECI1P42126 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECI1P42126 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ECI1P42126 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ECI1P42126 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECI1P42126 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECI1P42126 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECI1P42126 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECI1P42126 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECI1P42126 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECI1P42126 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECI1P42126 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECI1P42126 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ECI1P42126 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ECI1P42126 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECI1P42126 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECI1P42126 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECI1P42126 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECI1P42126 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECI1P42126 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECI1P42126 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ECI1P42126 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECI1P42126 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECI1P42126 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECI1P42126 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECI1P42126 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECI1P42126 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECI1P42126 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECI1P42126 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECI1P42126 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECI1P42126 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECI1P42126 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ECI1P42126 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECI1P42126 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ECI1P42126 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECI1P42126 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECI1P42126 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECI1P42126 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ECI1P42126 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECI1P42126 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECI1P42126 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECI1P42126 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECI1P42126 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECI1P42126 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECI1P42126 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECI1P42126 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECI1P42126 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECI1P42126 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECI1P42126 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECI1P42126 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECI1P42126 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECI1P42126 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECI1P42126 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECI1P42126 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ECI1P42126 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECI1P42126 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECI1P42126 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECI1P42126 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECI1P42126 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECI1P42126 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECI1P42126 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECI1P42126 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECI1P42126 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECI1P42126 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ECI1P42126 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECI1P42126 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECI1P42126 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECI1P42126 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECI1P42126 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECI1P42126 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECI1P42126 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECI1P42126 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ECI1P42126 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECI1P42126 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECI1P42126 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECI1P42126 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECI1P42126 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECI1P42126 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECI1P42126 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECI1P42126 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ECI1P42126 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ECI1P42126 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms