Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL1P40616 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL1P40616 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL1P40616 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL1P40616 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL1P40616 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARL1P40616 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARL1P40616 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARL1P40616 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARL1P40616 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARL1P40616 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARL1P40616 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARL1P40616 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL1P40616 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL1P40616 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL1P40616 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL1P40616 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL1P40616 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL1P40616 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL1P40616 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL1P40616 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL1P40616 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL1P40616 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL1P40616 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL1P40616 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL1P40616 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL1P40616 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL1P40616 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL1P40616 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL1P40616 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL1P40616 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL1P40616 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL1P40616 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL1P40616 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL1P40616 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL1P40616 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL1P40616 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL1P40616 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL1P40616 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL1P40616 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL1P40616 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL1P40616 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL1P40616 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL1P40616 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL1P40616 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL1P40616 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL1P40616 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL1P40616 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL1P40616 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL1P40616 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL1P40616 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL1P40616 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL1P40616 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL1P40616 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL1P40616 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL1P40616 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL1P40616 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL1P40616 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL1P40616 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL1P40616 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL1P40616 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL1P40616 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL1P40616 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL1P40616 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL1P40616 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL1P40616 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL1P40616 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL1P40616 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL1P40616 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL1P40616 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL1P40616 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL1P40616 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL1P40616 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL1P40616 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL1P40616 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL1P40616 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL1P40616 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL1P40616 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL1P40616 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL1P40616 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL1P40616 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL1P40616 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL1P40616 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL1P40616 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL1P40616 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL1P40616 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL1P40616 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL1P40616 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL1P40616 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL1P40616 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL1P40616 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL1P40616 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL1P40616 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL1P40616 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL1P40616 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL1P40616 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL1P40616 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL1P40616 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL1P40616 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL1P40616 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms