Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR2IP36954 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms