Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD12P35452 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD12P35452 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms