Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNB1P35222 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms