Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA1P35221 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms