Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM5P33992 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM5P33992 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM5P33992 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM5P33992 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM5P33992 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM5P33992 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM5P33992 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM5P33992 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM5P33992 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM5P33992 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM5P33992 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM5P33992 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM5P33992 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM5P33992 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM5P33992 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM5P33992 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM5P33992 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM5P33992 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM5P33992 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM5P33992 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM5P33992 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM5P33992 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM5P33992 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM5P33992 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM5P33992 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM5P33992 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM5P33992 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM5P33992 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM5P33992 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM5P33992 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM5P33992 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM5P33992 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM5P33992 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM5P33992 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM5P33992 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM5P33992 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MCM5P33992 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MCM5P33992 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MCM5P33992 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MCM5P33992 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MCM5P33992 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM5P33992 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM5P33992 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM5P33992 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM5P33992 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM5P33992 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM5P33992 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM5P33992 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM5P33992 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM5P33992 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM5P33992 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM5P33992 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM5P33992 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM5P33992 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCM5P33992 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCM5P33992 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCM5P33992 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCM5P33992 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MCM5P33992 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCM5P33992 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCM5P33992 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCM5P33992 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM5P33992 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM5P33992 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM5P33992 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM5P33992 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM5P33992 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM5P33992 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM5P33992 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM5P33992 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM5P33992 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM5P33992 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM5P33992 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM5P33992 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM5P33992 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM5P33992 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM5P33992 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM5P33992 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM5P33992 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM5P33992 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM5P33992 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM5P33992 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM5P33992 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM5P33992 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM5P33992 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM5P33992 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM5P33992 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM5P33992 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM5P33992 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM5P33992 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM5P33992 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM5P33992 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM5P33992 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM5P33992 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM5P33992 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM5P33992 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM5P33992 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM5P33992 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM5P33992 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms