Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTX2P32243 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTX2P32243 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTX2P32243 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTX2P32243 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTX2P32243 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OTX2P32243 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
OTX2P32243 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTX2P32243 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTX2P32243 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
OTX2P32243 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTX2P32243 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTX2P32243 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTX2P32243 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTX2P32243 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTX2P32243 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTX2P32243 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTX2P32243 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTX2P32243 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTX2P32243 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
OTX2P32243 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTX2P32243 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTX2P32243 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTX2P32243 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTX2P32243 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX2P32243 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX2P32243 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX2P32243 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX2P32243 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX2P32243 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX2P32243 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX2P32243 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX2P32243 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX2P32243 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX2P32243 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX2P32243 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX2P32243 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX2P32243 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX2P32243 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX2P32243 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX2P32243 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX2P32243 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX2P32243 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX2P32243 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX2P32243 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX2P32243 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX2P32243 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX2P32243 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX2P32243 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX2P32243 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX2P32243 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX2P32243 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX2P32243 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX2P32243 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX2P32243 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX2P32243 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX2P32243 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX2P32243 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX2P32243 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX2P32243 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX2P32243 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX2P32243 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX2P32243 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX2P32243 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX2P32243 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX2P32243 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX2P32243 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX2P32243 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX2P32243 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX2P32243 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX2P32243 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX2P32243 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX2P32243 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX2P32243 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX2P32243 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX2P32243 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX2P32243 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX2P32243 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX2P32243 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX2P32243 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX2P32243 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX2P32243 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX2P32243 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
OTX2P32243 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
OTX2P32243 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
OTX2P32243 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
OTX2P32243 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
OTX2P32243 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTX2P32243 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTX2P32243 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTX2P32243 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTX2P32243 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTX2P32243 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTX2P32243 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTX2P32243 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTX2P32243 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTX2P32243 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTX2P32243 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTX2P32243 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX2P32243 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms