Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXA10P31260 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXA10P31260 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms