Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CMPK1P30085 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms