Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E2P29084 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF2E2P29084 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF2E2P29084 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms