Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms