Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLD1P28340 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
POLD1P28340 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLD1P28340 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLD1P28340 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLD1P28340 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLD1P28340 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
POLD1P28340 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLD1P28340 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLD1P28340 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
POLD1P28340 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLD1P28340 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLD1P28340 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLD1P28340 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLD1P28340 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLD1P28340 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLD1P28340 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLD1P28340 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLD1P28340 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLD1P28340 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLD1P28340 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
POLD1P28340 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLD1P28340 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
POLD1P28340 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLD1P28340 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLD1P28340 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLD1P28340 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLD1P28340 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLD1P28340 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLD1P28340 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLD1P28340 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLD1P28340 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLD1P28340 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLD1P28340 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLD1P28340 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLD1P28340 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
POLD1P28340 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
POLD1P28340 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLD1P28340 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
POLD1P28340 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLD1P28340 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLD1P28340 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD1P28340 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD1P28340 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD1P28340 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD1P28340 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD1P28340 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD1P28340 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD1P28340 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD1P28340 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD1P28340 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD1P28340 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD1P28340 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD1P28340 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD1P28340 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD1P28340 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD1P28340 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLD1P28340 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLD1P28340 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLD1P28340 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLD1P28340 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
POLD1P28340 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLD1P28340 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLD1P28340 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLD1P28340 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLD1P28340 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLD1P28340 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLD1P28340 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLD1P28340 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLD1P28340 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLD1P28340 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLD1P28340 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLD1P28340 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLD1P28340 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLD1P28340 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLD1P28340 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLD1P28340 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLD1P28340 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLD1P28340 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLD1P28340 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLD1P28340 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLD1P28340 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLD1P28340 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLD1P28340 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
POLD1P28340 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLD1P28340 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLD1P28340 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLD1P28340 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLD1P28340 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLD1P28340 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
POLD1P28340 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLD1P28340 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
POLD1P28340 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLD1P28340 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLD1P28340 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLD1P28340 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLD1P28340 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLD1P28340 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLD1P28340 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLD1P28340 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms