Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IL3RAP26951 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms