Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGA3P26006 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms