Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNCP24863 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNCP24863 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNCP24863 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNCP24863 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNCP24863 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNCP24863 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNCP24863 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNCP24863 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNCP24863 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNCP24863 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNCP24863 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNCP24863 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNCP24863 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNCP24863 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNCP24863 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNCP24863 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNCP24863 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNCP24863 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNCP24863 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNCP24863 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNCP24863 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNCP24863 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNCP24863 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNCP24863 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNCP24863 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNCP24863 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNCP24863 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNCP24863 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNCP24863 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNCP24863 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCNCP24863 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNCP24863 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNCP24863 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNCP24863 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNCP24863 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNCP24863 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNCP24863 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNCP24863 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNCP24863 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNCP24863 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNCP24863 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNCP24863 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNCP24863 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNCP24863 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNCP24863 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNCP24863 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNCP24863 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNCP24863 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNCP24863 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNCP24863 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNCP24863 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNCP24863 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNCP24863 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNCP24863 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNCP24863 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNCP24863 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNCP24863 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNCP24863 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNCP24863 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNCP24863 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNCP24863 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNCP24863 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNCP24863 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNCP24863 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNCP24863 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNCP24863 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNCP24863 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNCP24863 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNCP24863 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNCP24863 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNCP24863 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNCP24863 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNCP24863 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNCP24863 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNCP24863 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNCP24863 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNCP24863 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNCP24863 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNCP24863 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNCP24863 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNCP24863 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNCP24863 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNCP24863 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNCP24863 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNCP24863 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNCP24863 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNCP24863 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNCP24863 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNCP24863 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNCP24863 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNCP24863 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNCP24863 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNCP24863 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNCP24863 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNCP24863 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNCP24863 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNCP24863 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNCP24863 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNCP24863 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms