Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRGP23470 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRGP23470 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
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