Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ITGA6P23229 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGA6P23229 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms