Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ERBB3P21860 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ERBB3P21860 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms