Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms