Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCNA2P20248 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms