Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFKB1P19838 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms