Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A1P19634 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A1P19634 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms