Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TNNI3P19429 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNNI3P19429 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms