Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC2P18074 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms