Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMD1P17707 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMD1P17707 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMD1P17707 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AMD1P17707 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMD1P17707 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMD1P17707 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMD1P17707 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMD1P17707 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMD1P17707 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMD1P17707 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMD1P17707 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMD1P17707 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMD1P17707 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AMD1P17707 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AMD1P17707 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AMD1P17707 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AMD1P17707 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AMD1P17707 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AMD1P17707 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AMD1P17707 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AMD1P17707 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AMD1P17707 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AMD1P17707 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AMD1P17707 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
AMD1P17707 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
AMD1P17707 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AMD1P17707 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AMD1P17707 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
AMD1P17707 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMD1P17707 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AMD1P17707 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AMD1P17707 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AMD1P17707 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AMD1P17707 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMD1P17707 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMD1P17707 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMD1P17707 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AMD1P17707 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMD1P17707 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMD1P17707 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMD1P17707 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMD1P17707 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AMD1P17707 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMD1P17707 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AMD1P17707 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AMD1P17707 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AMD1P17707 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AMD1P17707 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AMD1P17707 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMD1P17707 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMD1P17707 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AMD1P17707 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AMD1P17707 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMD1P17707 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMD1P17707 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMD1P17707 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AMD1P17707 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMD1P17707 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMD1P17707 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AMD1P17707 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMD1P17707 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AMD1P17707 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AMD1P17707 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMD1P17707 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMD1P17707 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMD1P17707 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMD1P17707 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AMD1P17707 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AMD1P17707 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AMD1P17707 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AMD1P17707 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMD1P17707 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AMD1P17707 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AMD1P17707 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AMD1P17707 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AMD1P17707 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMD1P17707 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AMD1P17707 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMD1P17707 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
AMD1P17707 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMD1P17707 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AMD1P17707 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AMD1P17707 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AMD1P17707 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AMD1P17707 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AMD1P17707 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMD1P17707 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMD1P17707 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AMD1P17707 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMD1P17707 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AMD1P17707 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AMD1P17707 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMD1P17707 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AMD1P17707 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMD1P17707 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMD1P17707 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AMD1P17707 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AMD1P17707 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AMD1P17707 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms