Protein–RNA interactions for Protein: P17676

CEBPB, CCAAT/enhancer-binding protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPBP17676 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CEBPBP17676 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEBPBP17676 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEBPBP17676 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CEBPBP17676 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEBPBP17676 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEBPBP17676 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEBPBP17676 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEBPBP17676 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEBPBP17676 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEBPBP17676 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEBPBP17676 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEBPBP17676 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEBPBP17676 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEBPBP17676 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms