Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB8P17481 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB8P17481 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms