Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMGA1P17096 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA1P17096 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms