Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL3L1P16619 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms