Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTLA4P16410 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTLA4P16410 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTLA4P16410 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTLA4P16410 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTLA4P16410 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTLA4P16410 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTLA4P16410 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTLA4P16410 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTLA4P16410 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTLA4P16410 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTLA4P16410 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CTLA4P16410 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTLA4P16410 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTLA4P16410 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms