Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF3P15923 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF3P15923 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF3P15923 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF3P15923 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF3P15923 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF3P15923 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF3P15923 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF3P15923 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF3P15923 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF3P15923 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF3P15923 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCF3P15923 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCF3P15923 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCF3P15923 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCF3P15923 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF3P15923 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF3P15923 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF3P15923 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF3P15923 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF3P15923 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF3P15923 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF3P15923 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF3P15923 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF3P15923 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCF3P15923 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF3P15923 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF3P15923 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF3P15923 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF3P15923 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF3P15923 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF3P15923 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF3P15923 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF3P15923 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF3P15923 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCF3P15923 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF3P15923 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF3P15923 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF3P15923 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF3P15923 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF3P15923 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCF3P15923 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF3P15923 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF3P15923 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF3P15923 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF3P15923 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF3P15923 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF3P15923 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF3P15923 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF3P15923 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF3P15923 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF3P15923 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF3P15923 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF3P15923 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF3P15923 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF3P15923 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCF3P15923 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF3P15923 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF3P15923 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF3P15923 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF3P15923 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF3P15923 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF3P15923 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF3P15923 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF3P15923 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF3P15923 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF3P15923 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCF3P15923 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF3P15923 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF3P15923 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF3P15923 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF3P15923 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF3P15923 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF3P15923 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF3P15923 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF3P15923 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF3P15923 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCF3P15923 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms