Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAFP15056 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAFP15056 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAFP15056 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAFP15056 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAFP15056 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAFP15056 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAFP15056 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAFP15056 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAFP15056 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAFP15056 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAFP15056 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAFP15056 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAFP15056 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAFP15056 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAFP15056 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAFP15056 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAFP15056 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAFP15056 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAFP15056 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAFP15056 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAFP15056 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAFP15056 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAFP15056 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAFP15056 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAFP15056 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
BRAFP15056 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRAFP15056 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRAFP15056 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRAFP15056 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRAFP15056 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRAFP15056 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRAFP15056 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRAFP15056 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRAFP15056 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRAFP15056 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRAFP15056 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRAFP15056 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAFP15056 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAFP15056 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAFP15056 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAFP15056 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAFP15056 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAFP15056 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAFP15056 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAFP15056 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAFP15056 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAFP15056 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAFP15056 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAFP15056 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAFP15056 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAFP15056 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAFP15056 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAFP15056 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAFP15056 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAFP15056 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAFP15056 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAFP15056 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAFP15056 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAFP15056 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAFP15056 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAFP15056 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAFP15056 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAFP15056 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAFP15056 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAFP15056 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAFP15056 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAFP15056 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAFP15056 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAFP15056 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAFP15056 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRAFP15056 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRAFP15056 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRAFP15056 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRAFP15056 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRAFP15056 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRAFP15056 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRAFP15056 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRAFP15056 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRAFP15056 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRAFP15056 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRAFP15056 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRAFP15056 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRAFP15056 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRAFP15056 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRAFP15056 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRAFP15056 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRAFP15056 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRAFP15056 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRAFP15056 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRAFP15056 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAFP15056 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAFP15056 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAFP15056 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAFP15056 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAFP15056 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAFP15056 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAFP15056 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAFP15056 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAFP15056 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms