Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFAPP14136 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFAPP14136 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFAPP14136 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFAPP14136 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFAPP14136 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFAPP14136 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFAPP14136 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFAPP14136 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFAPP14136 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFAPP14136 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFAPP14136 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFAPP14136 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFAPP14136 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFAPP14136 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFAPP14136 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFAPP14136 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFAPP14136 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFAPP14136 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFAPP14136 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFAPP14136 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFAPP14136 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFAPP14136 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFAPP14136 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFAPP14136 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFAPP14136 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFAPP14136 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFAPP14136 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFAPP14136 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFAPP14136 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFAPP14136 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFAPP14136 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFAPP14136 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFAPP14136 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFAPP14136 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFAPP14136 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFAPP14136 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFAPP14136 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFAPP14136 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFAPP14136 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GFAPP14136 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFAPP14136 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFAPP14136 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GFAPP14136 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GFAPP14136 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFAPP14136 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFAPP14136 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFAPP14136 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFAPP14136 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFAPP14136 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFAPP14136 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFAPP14136 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFAPP14136 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFAPP14136 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFAPP14136 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFAPP14136 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFAPP14136 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFAPP14136 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFAPP14136 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFAPP14136 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFAPP14136 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFAPP14136 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFAPP14136 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFAPP14136 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFAPP14136 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFAPP14136 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFAPP14136 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFAPP14136 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFAPP14136 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFAPP14136 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFAPP14136 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFAPP14136 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GFAPP14136 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFAPP14136 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GFAPP14136 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFAPP14136 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFAPP14136 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFAPP14136 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFAPP14136 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFAPP14136 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFAPP14136 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFAPP14136 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GFAPP14136 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFAPP14136 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFAPP14136 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFAPP14136 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFAPP14136 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFAPP14136 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFAPP14136 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFAPP14136 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFAPP14136 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFAPP14136 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFAPP14136 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFAPP14136 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFAPP14136 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFAPP14136 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFAPP14136 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GFAPP14136 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GFAPP14136 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GFAPP14136 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms