Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC130P13994 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC130P13994 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC130P13994 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms