Protein–RNA interactions for Protein: P13861

PRKAR2A, cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR2AP13861 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAR2AP13861 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAR2AP13861 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAR2AP13861 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAR2AP13861 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAR2AP13861 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAR2AP13861 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAR2AP13861 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAR2AP13861 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAR2AP13861 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAR2AP13861 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAR2AP13861 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAR2AP13861 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAR2AP13861 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAR2AP13861 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAR2AP13861 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAR2AP13861 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAR2AP13861 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAR2AP13861 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAR2AP13861 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAR2AP13861 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAR2AP13861 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAR2AP13861 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms