Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNT1P13805 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms